Які сили визначають зв'язування субстрату?

2024 Від admin

Субстрат зв'язується з активним центром ферменту за допомогою різних взаємодій. Ці сили є Ван-дер-Вааль, взаємодії, іонний зв'язок, водневий зв'язок або диполь-дипольна взаємодія.

Перша модель, яка називається моделлю замка та ключа, пропонує це форма та хімічний склад субстрату доповнюють форму та хімічний склад активного центру ферменту. Це означає, що коли субстрат потрапляє в активний центр, він ідеально підходить, і вони зв’язуються разом, утворюючи фермент-субстратний комплекс.

Найважливішим фактором у визначенні того, чи буде фермент діяти на конкретний субстрат для отримання продукту, є стабільність пов'язаного з ферментом перехідного стану які треба було б сформувати.

Субстрат зв'язується з ферментом переважно через водневий зв'язок та інші електростатичні взаємодії.

Субстрати спочатку зв'язуються з активним центром шляхом нековалентні взаємодії, включаючи водневі зв'язки, іонні зв'язки та гідрофобні взаємодії. Коли субстрат зв’язується з активним центром ферменту, численні механізми можуть прискорити його перетворення на продукт реакції.

Ці сили є Ван-дер-Вааль, взаємодії, іонний зв'язок, водневий зв'язок або диполь-дипольна взаємодія.

Факторами, що впливають на субстратну специфічність ферменту є стереоспецифічність і геометрична специфічність.