Який найкращий стоп-кодон?
2024TAA виявляється найефективнішим, тоді як TGA є найменш ефективним із значним наскрізним зчитуванням через неправильне тлумачення стоп-кодону. Оскільки ТАА є найефективнішим термінуючим кодоном, кодони ТАА зберігаються шляхом очищення відбору в усіх сферах життя, особливо в генах з високою експресією5,6.31 серпня 2023 р
(11) проаналізували понад 70 000 генів еукаріотів, включаючи гриби, рослини та людину. Знайшли TAA бути найбільш поширеним стоп-кодоном у нижчих еукаріот, тоді як у вищих еукаріотів TGA був найбільш поширеним.
Стоп-кодон Стоп-кодон — це послідовність із трьох нуклеотидів (тринуклеотид) у ДНК або інформаційній РНК (мРНК), яка сигналізує про зупинку синтезу білка в клітині. Існує 64 різні тринуклеотидні кодони: 61 визначає амінокислоти, а 3 є стоп-кодонами (тобто СУА, СУАГ і УГА).
Ми спостерігали, що UAA був найсильнішим стоп-кодоном і УГА був найслабшим.
UAG The бурштиновий стоп-кодон (TAG у ДНК, UAG у РНК) є одним із трьох кодонів, які використовуються для припинення трансляції новонародженого білка в рибосомі. У геномі людини цей кодон використовується найменш часто, він знаходиться в кінці ~ 20% генів (Sun, Chen, Xu, & Luo, 2005).');})();(function(){window .jsl.dh('5L3UZqGZHfXfwN4P7vyxsQ4__37','
Цей оптимальний кодон також зазвичай збагачений генами з більш високою експресією. Більшість організмів також мають три альтернативні варіанти для стоп-кодону (UAA, UGA та UAG у мРНК або TAA, TGA та TAG у геномній послідовності).
У генетичному коді є 3 STOP-кодони – СУГ, СУА та УГА. Ці кодони сигналізують про закінчення поліпептидного ланцюга під час трансляції. Ці кодони також відомі як безглузді кодони або термінаційні кодони, оскільки вони не кодують амінокислоти.